伊犁職業(yè)技術學院設有動物科學學院、農業(yè)工程學院、機電化工學院、信息技術學院、經濟管理學院、文教學院、體育學院、馬克思主義學院及其他學院，以下是具體名單，以供參考，可調整的，以學校最新公告為準。

1、學院設置

動物科學學院

農業(yè)工程學院

機電化工學院

信息技術學院

經濟管理學院

文教學院

體育學院

馬克思主義學院

2、伊犁職業(yè)技術學院簡介

新疆維吾爾自治區(qū)伊犁職業(yè)技術學院、經伊犁哈薩克自治州人民政府批準，2002年3月11日由原新疆伊犁畜牧獸醫(yī)學校創(chuàng)建、伊犁農業(yè)學校、伊犁農牧機械化學校三所中等職業(yè)學校合并成立，這是一所以農業(yè)科學為主的學校，以畜牧獸醫(yī)為特色，一所文科與理科并重的公辦普通高等職業(yè)院校。

原新疆伊犁畜牧獸醫(yī)學校成立于1956年、伊犁農業(yè)學校成立于1955年、伊犁農牧機械化學校始建于1965年，這三所學校都是自治區(qū)較早創(chuàng)辦的重點中等職業(yè)學校。