黑龍江農業(yè)經濟職業(yè)學院設有經濟管理系、信息工程、智慧農業(yè)系、動物技術系、食品藥品工程系、機電工程、人文藝術系、思想政治理論課教研室等部門，以下是具體名單，以供參考，可調整的，以學校最新公告為準。

一、學院

經濟管理系

信息工程

智慧農業(yè)系

動物技術系

食品藥品工程系

機電工程

人文藝術系

思想政治理論課教研室

二、黑龍江農業(yè)經濟職業(yè)學院簡介

黑龍江農業(yè)經濟職業(yè)學院，經省政府批準、教育部注冊、面向全國招生的公辦全日制綜合性高等教育機構，黑龍江省農業(yè)委員會所屬。2016年8月，入選第二批國家現(xiàn)代學徒制試點單位。

學院成立于1958年，前身為東北農學院牡丹江分校，院系本科制。建校以來，農業(yè)部、教育部、被省委、省政府授予A級學校，國家示范性高職院校，教育部高職院校人才培養(yǎng)工作評估優(yōu)秀單位，黑龍江省職業(yè)教育先進單位，黑龍江省高校就業(yè)工作先進單位；農業(yè)部、科技部將其確立為國家現(xiàn)代農業(yè)技術培訓基地，俄羅斯出口型星火工業(yè)科技培訓基地；現(xiàn)為全國“五四”紅旗團委學院、省級文明單位示范單位、國家AAA級旅游景區(qū)校園。這些年來，作為全國100所國家級示范學校之一，學院特色鮮明，創(chuàng)辦中等和高等職業(yè)學校、本專業(yè)人才培養(yǎng)暢通“立交橋”，創(chuàng)建全國知名高等職業(yè)學校。